关于大蛇丸这边的事情要想讲清楚，我们还需要把时间线稍微往前调上一点点，回到宇智波带土向五影宣战，第四次忍界大战真正爆发的开端。
在有关对于晓组织处理办法的会议之后。
子夜被新上任的忍者联军统帅，四代目火影·波风水门单独留下，进行了单独的会议商谈：
“关于大蛇丸，你怎么看？”波风水门淡淡的问。
“大蛇丸竟然会跟宇智波带土联合到一起，这确实出乎我的意料。”
子夜听到波风水门的问话，立刻正色答道。
原本应该和宇智波带土联合的是药师兜，但是药师兜已经被自己忽悠成了打工人，对于药师兜影响极大的药师野乃宇也没有死亡，而是依然好好的在木叶经营着自己的孤儿院。
过上了梦想中的生活，药师兜自然不可能如原著中一样，去和宇智波带土合作。
没有进入大蛇丸麾下，继承大蛇丸衣钵的药师兜，也没有与宇智波带土合作的基础。
大蛇丸和宇智波带土两人本就是木叶的叛忍，是在忍界中见不得光的存在，后来他们又从统一了黑暗世界的晓组织中叛逃。
同时得罪了忍界黑白两道的二人，好似丧家之犬一般，只能躲在黑暗的角落中瑟瑟发抖。
这样的情况持续了很长一段时间。
子夜本以为，事情会一直这样下去。
最少也更够持续到他完成自己的计划，在剧情开始之前的几年内，不会出现打的变化。
子夜原本的计划是：
自己和阳神分身相互配合，收集九只尾兽合成十尾，然后自己使用拘灵遣将控制十尾，成为十尾人柱力。
让自己在实力上一步登天的同时，还彻底摧毁了宇智波带土等人计划的核心。
没有了十尾，宇智波斑和宇智波带土的实力就算再强，特性再麻烦，也在可以控制的范围内。
但令子夜没有想到。
没有了继承大蛇丸衣钵的药师兜。
大蛇丸自己却和同样是丧家之犬的宇智波带土联合到了一起。
这两个曾经失意者在走到了一起之后，竟然奇妙的产生了意想不到的化学反应。
大蛇丸掌握有《秽土转生》这种核心技术，他还在幕后控制了整个音忍村，拥有大量的实验素材。
宇智波带土则拥有白绝这种，可以使用“蜉蝣之术”在土壤岩石之中肆意遨游的“挖坟鬼才”，能够将无数已故的忍界强者挖掘出来，用这些强者的血脉给大蛇丸做实验。
这两个人，一个掌握核心技术，一个拥有大量资源。
一拍即合之下，让大蛇丸的研究进度飞速提高。
虽然这两个家伙都算不上是什么好人，二人在合作的同时，还都在想着如何将对方一口吞掉。
但无论是之前被驱逐的遭遇，还是子夜所表现出来的强大实力。
都让这两人明白，实力才是一切的根本。
因此，关于在合作中提升自身的实力这个问题上，双方都没有丝毫保留，不过最后的结果如何，却是显而易见的。
在这个过程中，老奸巨猾的大蛇丸，最终还是比宇智波带土这个学渣技高一筹。
大蛇丸利用宇智波带土提供的无数强者身体和稀有血继限界，对自己的身体做了无数次实验，最终不止让他完善了二代火影留下的《秽土转生》，更掌握了白蛇仙人模式，让他可以控制这些转生的秽土忍者。